Laboratoire de pharmacogénétique clinique

Le laboratoire de génétique médicale et de diagnostic moléculaire de l'université d'Üsküdar réalise des études de génotypage pour déterminer les profils pharmacogénétiques des individus. Notre laboratoire a été conçu en fonction des études à réaliser au niveau moléculaire et un laboratoire de génétique médicale et de diagnostic moléculaire doté des machines et équipements nécessaires a été créé.

Dans notre laboratoire, l'isolement de l'ADN / ARN est effectué à partir du sang ou de tout échantillon de tissu prélevé sur les patients pour le génotypage. Ces échantillons peuvent ensuite être utilisés pour le génotypage ou la détermination des niveaux d'expression. Des études conventionnelles de PCR (réaction en chaîne de la polymérase, PCR), d'analyse des fragments de coupe par enzyme de restriction (RFLP) et d'analyse de séquence sont réalisées pour les études de génotypage. En outre, des analyses plus sensibles sont réalisées avec la PCR en temps réel dans notre laboratoire.

Les études de génotypage complètent les études phénotypiques dans certains cas et les précèdent dans d'autres. En assurant la corrélation génotype-phénotype, un programme de traitement plus efficace est appliqué aux patients dans un délai plus court et avec des effets secondaires minimisés. Les analyses génotypiques des groupes CYP2D6, CYP2C9, CYP2C19, CYP1A2 et CYP3A4, le polymorphisme 5HTT et COMT sont les principaux gènes génotypés.

Que fait le laboratoire de pharmacogénétique clinique ?

Dans le cadre du "traitement personnalisé", la pharmacogénétique étudie les changements dans les réponses des individus aux médicaments en raison des variations de leur structure génétique. Les différences dans les structures génétiques qui sont impliquées dans le métabolisme des médicaments ou qui sont actives dans le fonctionnement du mécanisme peuvent affecter l'utilité et/ou les effets nocifs du médicament chez certaines personnes. Certains tests génétiques appliqués aujourd'hui permettent de détecter à l'avance des affections qui pourraient être inutiles ou avoir des effets secondaires importants.

Qu'est-ce qu'un test pharmacogénétique ?

Les tests pharmacogénétiques sont des tests génétiques qui permettent de prédire les effets des médicaments sur l'organisme et de mettre au point des traitements personnalisés en examinant la structure génétique des individus. Ces tests visent à identifier les variations génétiques spécifiques associées au métabolisme, au mécanisme d'action et aux effets secondaires des médicaments. Les tests pharmacogénétiques peuvent aider à déterminer le traitement le plus efficace et le plus sûr pour le patient et à minimiser les effets secondaires. Aujourd'hui, deux méthodes principales sont appliquées dans le traitement des maladies :

1. La méthode des essais et des erreurs : Elle est appliquée jusqu'à ce que le médicament montre son effet.
2. La méthode du protocole : Le diagnostic est posé en premier. Les médicaments sont administrés conformément au schéma décisionnel du protocole.

Les études pharmacogénétiques ont deux applications principales en clinique :

1. Évaluation de la réponse aux médicaments : Il s'agit de déterminer quels patients répondront bien à certains médicaments et lesquels n'y répondront pas. De cette manière, les processus de traitement efficaces sont personnalisés.
2. Prévention des effets secondaires : Les patients chez qui les médicaments peuvent provoquer des effets secondaires sont identifiés à l'avance. Cela permet de réduire le risque d'effets secondaires et d'accroître la sécurité des médicaments.

Des tests de laboratoire sont utilisés à cette fin. La surveillance des concentrations sanguines des médicaments thérapeutiques (TDM) permet de contrôler les effets des médicaments et de déterminer les profils génétiques. Le phénotypage est également réalisé à l'aide de "médicaments sondes". La science pharmacogénétique prédit les réponses aux médicaments, les interactions et les effets secondaires en fonction de la structure génétique des patients et contribue au développement d'une approche thérapeutique personnalisée.

Dans notre pays, les mesures des concentrations sanguines de médicaments sont limitées et effectuées par des méthodes non spécifiques. Cependant, la pharmacogénétique vise à améliorer l'efficacité et la sécurité de la thérapie médicamenteuse en développant une approche thérapeutique personnalisée. Les avancées dans ce domaine peuvent contribuer à une meilleure gestion des maladies et à une meilleure réponse au traitement.

À quelles fins les tests pharmacogénétiques sont-ils utilisés ?

Les tests pharmacogénétiques sont des tests génétiques qui permettent de prédire les effets des médicaments sur l'organisme et de développer des traitements personnalisés en examinant la structure génétique des individus. Ces tests sont utilisés dans les buts suivants :

Prévoir la réponse aux médicaments : Les tests pharmacogénétiques permettent de déterminer si un médicament est adapté au profil génétique d'une personne. Les médicaments peuvent agir différemment chez chaque individu, et ces tests peuvent aider à prédire comment un médicament répondra à la maladie d'une personne.

Ajustement de la posologie des médicaments : Les différences génétiques entre les individus peuvent avoir un effet sur le métabolisme des médicaments. Les tests pharmacogénétiques peuvent être essentiels pour déterminer la dose appropriée d'un médicament. L'ajustement du dosage en fonction du profil génétique de l'individu peut améliorer l'efficacité du traitement et réduire les effets secondaires.

Minimiser les effets secondaires : Les effets secondaires de certains médicaments peuvent être dus à des variations génétiques individuelles. Les tests pharmacogénétiques peuvent prédire quels sont les effets secondaires à risque et contribuer à rendre le traitement plus sûr.

Examen des conditions de résistance au traitement : Certains patients peuvent présenter une résistance à certains médicaments. Les tests pharmacogénétiques peuvent aider à identifier cette cause de résistance et des options thérapeutiques alternatives peuvent être recommandées.

Évaluation des interactions médicamenteuses : Les tests pharmacogénétiques peuvent aider à évaluer comment plusieurs médicaments utilisés en même temps interagissent dans l'organisme. Ceci est important pour la sécurité et l'efficacité des combinaisons de médicaments.

Développement et sélection des médicaments : Les études pharmacogénétiques sont utilisées dans les processus de développement des médicaments et pour déterminer si les nouveaux médicaments conviennent aux patients présentant des profils génétiques spécifiques. Cela peut aider à concevoir des thérapies plus ciblées.

Brochure Traitement personnalisé

Cliquez ici pour télécharger la brochure "Traitement personnalisé ; pharmacogénétique clinique, options thérapeutiques génétiquement appropriées".

LISTE DES MOLÉCULES TDM
S.No	Substance active	Médicament Demi-vie (t 1/2)(Heure-Jour)	Intervalle thérapeutique	Niveau d'alarme	Séquence d'utilisation des médicaments recommandée pour le TDM
1.	Alprazolam	12-15 heures	20-40	100 ng/ml	3
2.	Acomprosate	3-33 heures	250-700	1000 ng/ml	3
3.	Amisulpiride	12-20 heures	100-320	640 ng/ml	1
4.	Amitriptyline + Nortriptyline	10-28 heures + 18-44 heures	80-200	300 ng/ml	1
5.	Aripiprazole	60-80 heures	100-350	1 000 ng/ml	2
6.	Asénapine	13-39 heures	1-5	10 ng/ml	4
7.	Atomoxétine	2-5 heures	200-1000	2 000 ng/ml	3
8.	Bupropion + Hydroxybupropion	1-15 heures + 17-47 heures	850-1500	2 000 ng/ml	2
9.	Buspirone	1-5 heures	1-4	30 ng/ml	3
10.	Carbamazépine	10-20 heures	4-12	20 µg/ml	1
11.	Carbamazépine 10-11Epoxyde	-	0.4-4	4 µg/ml	-
12.	Chlorpromazine	15-30 heures	30-300	600 ng/ml	2
13.	Citolopram	38-48 heures	50-110	220 ng/ml	1
14.	Clomipramine	16-60 heures	230-450	450 ng/ml	1
15.	Clonazépam	19-40 heures	4-80	100 ng/ml	3
16.	Clozapine+Norclozapine	12-16 heures	350-600	1 000 ng/ml	1
17.	DDTC_ME ( Disulfiram Diethylthiomethylcarbamate-methyl ester )	6-9 heures	270-310	500 ng/mL	3
18.	Diazépam	24-48 heures	100-2500	3000 ng/ml	4
19.	Donépézil	70-80 heures	50-75	75 ng/ml	2
20.	Duloxétine	9-19 heures	30-120	240 ng/ml	2
21.	Escitalopram	27-32 heures	15-80	160 ng/ml	2
22.	Fluoxétine	4-6 jours	120-500	1 000 ng/ml	3
23.	Flupentixol	20-40 heures	0.5-5	15 ng/ml	2
24.	Fluphénazine	16 heures	1-10	15 ng/ml	1
25.	Fluvoxamine	21-43 heures	60-230	500 ng/mL	2
26.	Gabapentine	5-7 heures	2-20	25 µg/ml	3
27.	Halopéridol	12-36 heures	1-10	15 ng/ml	1
28.	Imipramine + Désimipramine	11-25 heures + 15-18 heures	175-300	300 ng/ml	1
29.	Lacosamide	10-15 heures	1-10	20 µg/ml	3
30.	Lamotrigine	14-104 heures	1-15	20 µg/ml	2
31.	Levetiracetam	6-8 heures	20-40	50 µg/ml	4
32.	Lorazépam	12-16 heures	30-100	300 ng/ml	4
33.	Maprotiline	20-58 heures	75-130	220 ng/ml	2
34.	Mémantine	60-100 heures	90-150	300 ng/ml	3
35.	Metformine	6,2 heures	1-2	5 µg/ml	-
36.	Méthylphénidate	2 heures	6-26	50 ng/ml	3
37.	Miansérine	14-33 heures	15-70	140 ng/ml	3
38.	Milnacipran	5-8 heures	100-150	300 ng/ml	2
39.	Mirtazapine	20-40 heures	30-80	160 ng/ml	2
40.	Moclobémide	2-7 heures	300-1000	2 000 ng/ml	3
41.	Modafinil	10-12 heures	100-1700	3 400 ng/ml	3
42.	Naltrexone + 6β-naltrexol	2-5 heures + 7-13 heures	25-100	200 ng/ml	2
43.	Olanzapine	30-60 heures	20-80	100 ng/ml	1
44.	Opipramol	11 heures	50-500	1000 ng/ml	3
45.	Oxcarbamazépine (Oxcarbazépine 10-hydroxycarbazépine)	10-20 heures	10-35	40 µg/ml	2
46.	Palipéridone (9-hydroxyrispéridone)	17-23 heures	20-60	120 ng/ml	2
47.	Paroxétine	12-44 heures	20-65	120 ng/ml	3
48.	Pimozide	23-43 heures	15-20	20 ng/ml	3
49.	Pramipexole	8-12 heures	0.4-1.2	15 ng/ml	3
50.	Prégabaline	5-7 heures	2-5	10 µg/ml	3
51.	Quetiapine	6-13 heures	100-500	1 000 ng/ml	2
52.	Reboxétine	13-30 heures	60-350	700 ng/ml	3
53.	Rispéridone + 9-hydroxy-rispéridone	2-4 heures + 17-23 heures	20-60	120 ng/ml	2
54.	Rivastigmine	1-2 heures	8-20	40 ng/ml	3
55.	Sertindole	55-90 heures	50-100	200 ng/ml	2
56.	Sertraline	22-36 heures	10-150	300 ng/ml	2
57.	Sulpiride	8-14 heures	200-1000	1 000 ng/ml	2
58.	Tianeptine	2,5-3 heures	30-80	160 ng/ml	3
59.	Topiramate	19-23 heures	2-10	16 µg/ml	3
60.	Trazodone	4-11 heures	700-1000	1 200 ng/ml	2
61.	Trifluopérazine	-	1-2.3	-	-
62.	Venlafaxine + O-desméthylvenlafaxine (ODV)	14-18 heures + 10-17 heures	100-400	800 ng/ml	2
63.	Acide valproïque	17-30 heures	50-100	120 µg/ml	1
64.	Vortioxétine	57-66 heures	10-40	80 ng/ml	2
65.	Ziprasidone	4-8 heures	50-200	400 ng/ml	2
66.	Zolpidem	1-4 heures	80-160	320 ng/ml	4
67.	Zuclopenthixol	15-25 heures	4-50	100 ng/ml	3